Appendix 1. Frequency distributions for all loci. Designations are mobility and combination scores and may not reflect character codes (see text for character coding rules). Abbreviations for taxa: Amastridium veliferum = AV, Alsophis antillensis = AA, A . cantherigerus = AC, A . elegans = AE, A . portoricensis = AP, A . rijersmai = AR, A . vudii = AVU, Antillophis parvifrons = ANP, Arrhyton callilaemum = ARC, A . exiguum = ARE, A . funereum = ARF, A . landoi = ARL, A . polylepis = ARP, A . taeniatum = ART, Coniophanes fissidens = CF, Conophis lineatus = CL, Crisantophis nevermanni = CN, Darlingtonia haetiana = DH, Enulius flavitorques = EF, Farancia abacura = FA, Geophis hoffmanni = GH, G . zeledoni = GZ, Hypsirhynchus ferox = HF, Ialtris dorsalis = ID, Imantodes cenchoa = IC, I . inornatus = II, Leptodeira septentrionalis = LS, Manolepis putnami = MP, Nerodia fasciata = NF, Ninia maculata = NM, N . psephota = NP, Oxyrhopus petola = OP, Rhadinaea calligaster = RC, R . godmani = RG, Saphenophis sneiderni = SS, Sibon nebulata = SN, Tretanorhinus nigroluteus = TN, Uromacer catesbyi = UC, U . frenatus = UF, U . oxyrhynchus = UO, Urotheca guentheri = UG, Xenodon rabdocephalus = XR.

LOCI

TAXA mAcon sAcon Adh Ap Cat Gcdh Gpi Gtdh Icdh Iddh
AV B B A -- B -- K B E C
AA B B A A C B F A F D
AC A B B A B B G A B A
AE A C(.50)
D(.50)
B A C(.50)
G(.50)
B F A A D
AP A B B A A A G D F A
AR B B A A C D F D E F
AVU A(.50)
B(.50)
B B A B(.75)
C(.25)
B G A A A
ANP A B B A A(.07)
B(.79)
C(.14)
A F A F D
ARC G B B A B(.50)
F(.50)
A F(.25)
G(.75)
B F A
ARE B B B B(.66)
C(.33)
B(.66)
C(.33)
D C A A A
ARF G B B A(.80)
E(.20)
B A C B F A
ARL A B B A(.75)
F(.25)
C A(.50)
B(.50)
A A A(.50)
D(.50)
B
ARP C B B E B D C A F A
ART A B B A A D D A A --
CF B A C A(.50)
D(.50)
B B A D F --
CL A B -- -- B -- B D B --
CN B F -- A D -- -- A F --
DH B B B A B(.50)
C(.10)
E(.40)
A F B(.90)
C(.10)
A(.60)
F(.40)
A
EF G A -- -- B -- A A F --
FA B B B A I A G A F A
GH B B D -- B -- L A E --
GZ B B A H B B L A E --
HF A C B A B(.80)
I(.20)
A C(.75)
F(.25)
A F A
ID A B B A H D G A D D
IC H E C H B B E A(.57)
B(.14)
E(.29)
F
II I A D H B B(.66)
F(.33)
B A F --
LS A(.90)
J(.10)
A A(.11)
C(.22)
E(.67)
B(.10)
E(.90)
A(.10)
B(.20)
C(.30)
D(.10)
F(.20)
J(.10)
D A A F --
MP B C B A I C A A E --
NF B A A G A D(.75)
G(.25)
A D B --
NM F B E -- J -- K A F --
NP J C -- -- B -- E A F --
OP A B B A C A I D E --
RC B B A E B(.25)
C(.75)
-- F B E C
RG E B -- E C -- F B E --
UG H E A E C E F B E C
SS A G F -- K A A -- A --
SN B B -- A B B E A A --
TN B D E -- B B K A A --
UC A B(.70)
D(.30)
A(.06)
B(.94)
A A(.10)
B(.90)
A A(.10)
C(.10)
F(.50)
H(.30)
A(.28)
B(.72)
A A
UF B B(.66)
D(.33)
A A B A A(.28)
C(.28)
F(.43)
A A A
UO B B A A B A A(.50)
F(.50)
A A A
XR F C B A B -- M A B --

LOCI

TAXA Ldh-A Ldh-B Pep-B Pep-S Pep-D Pgdh-1 Pgdh-2 Pgm Sod
A M G E C A A -- H A
AA C C A A A B E A D
AC C C A A A B E A(.40)
C(.60)
D(.50)
F(.50)
AE C C A A A B E A H(.50)
I(.50)
AP C C A A A B E A A
AR C C A A A B E A A
AVU C C A A A B E A D
ANP A(.50)
D(.50)
B C D A B A(.40)
E(.60)
A A
ARC F B E B A B A A D
ARE K B A A A H C(.66)
H(.33)
A E
ARF B B E B C B A D(.17)
F(.83)
D(.75)
F(.25)
ARL L C E C A H C(.50)
H(.50)
A A
ARP B B E B C B A C(.50)
D(.50)
D
ART F B E C A A -- H D
CF H I A F -- C -- A D
CL H I -- -- -- D -- A D
CN H I B B -- A -- A D
DH G C C B B B(.80)
E(.20)
A(.89)
G(.11)
A(.80)
C(.10)
D(.10)
D
EF H I -- -- -- B -- A J
FA D K B A C -- C A D
GH H I B B -- A -- A L
GZ N D B B -- A -- A K
HF D B C A D H D A B
ID C B A A A B E A D
IC H H B B -- F -- D(.71)
ME(.29)
II O F B B -- F -- A(.33)
B(.33)
H(.33)
D
LS H K C(.90)
D(.10)
A A C(.30)
F(.70)
-- A D(.30)
L(.70)
MP I H A A A B F B C
NF D K C A A C(.12)
F(.88)
-- A(.88)
E(.12)
K
NM D K C -- A A -- B G
NP D K C E A A -- B D
OP D E C D -- C -- A M
RC D J A A A A C A D
RG D J A A A H C A D
UG D J A A A H C A D
SS P A -- D -- B -- A H
SN I H C D -- B -- B K
TN Q K C A -- B -- B H
UC F B A A A A B(.05)
C(.95)
A A
UF F B A A A A A(.20)
C(.80)
A A
UO F B A A A A C A A
XR ? B C A -- G -- B M